增值稅稅率不同 -2019年起一般納稅人的增值稅稅率有4檔：13%、9%、6%、0；小規(guī)模納稅人增值稅沒有稅率，只有一個征收率3%，特殊行業(yè)是5%。2- 計稅方式不同 -一般納稅人增值稅抵扣計算=銷項稅額-進項稅額-減免稅額=應納增值稅；小規(guī)模納稅人增值稅直接計算=收入*征收率3%。3- 使用發(fā)票不同 -一般納稅人可以自行開具增值稅專用發(fā)票和增值稅普通發(fā)票，也可以開具4檔稅率的增值稅發(fā)票，收票方也能抵扣13%-6%的進項稅額；小規(guī)模納稅人可以開具增值稅普通發(fā)票，收票方不能抵扣進項稅額；小規(guī)模需要開具專用發(fā)票，稅率是3%的專票，收票方可以抵扣進項稅額，不享受每個季度的免征額。4- 稅收優(yōu)惠不同 -一般納稅人在增值稅方面一般很少有優(yōu)惠政策；2019年起小規(guī)模納稅人在增值稅方面可以享受：季度收入30萬以免交增值稅的優(yōu)惠征策，附加稅減半征收入的征策。5- 認定方式不同 -新成立的企業(yè)，如果沒有去選擇申請一般納稅人，就自動認定為小規(guī)模納稅人；一般納稅人需要去申請才能認定，認定方式有兩種：一是有固定辦公場所，可以去申請認定，別外一種是銷售額超過了500萬，也可能去申請認定。6- 申報時間及方式不同 -一般納稅人都是按月申報，并且增值稅要在特定的系統(tǒng)內才能申報；小規(guī)模納稅人可以選擇按月申報，也可以選擇按季申報，增值稅不需要特定的系統(tǒng)就可以完成申報工作了。

從稅負上看，不同行業(yè)、不同企業(yè)的增值稅稅負由于增值率的不同而有所不同。一般納稅人和小規(guī)模納稅人比較，在增值稅轉型前，有關專家認為一般納稅人的平均稅負在7%左右。工業(yè)小規(guī)模納稅人的征收率為6%，商業(yè)小規(guī)模納稅人的征收率為3%。由于小規(guī)模納稅人財務核算不健全，稅務機關難以準確掌握其銷售收入，小規(guī)模納稅人的實際增值稅稅負比征收率還要低。行增值稅轉型后，增值稅一般納稅人購進生產性固定資產的進項稅金可以抵扣，加上一般納稅人認定門檻的降低，人們原以為小規(guī)模納稅人申請一般納稅人資格的積極性會增加。

　　從管理成本上看，一般納稅人和小規(guī)模納稅人由于稅收征管的差異，管理成本也存在不同。納稅人要達到按照國家統(tǒng)一的會計制度規(guī)定設置賬簿，根據合法、有效憑證核算，能夠提供準確稅務資料的要求，就需要配置財務人員，或者聘請中介機構代理記賬、核算，無疑會增加支出。一些小規(guī)模納稅人不愿變?yōu)橐话慵{稅人的一個原因。從制度設計上看，一般納稅人實行進項抵扣制度，按照規(guī)范的增值稅計算方法，即銷項稅額減去進項稅額的方法納稅。應納稅額計算公式：應納稅額=當期銷項稅額－當期進項稅額。一般納稅人涉及較為復雜的銷項稅額和進項稅額的計算，其增值稅的基本稅率為17%。而小規(guī)模納稅人實行按照銷售額和征收率計算應納稅額的簡易辦法，不得抵扣進項稅額，目前的征收率為3%。應納稅額計算公式：應納稅額=銷售額×征收率。