根據(jù)《食品安全法》和總局的有關(guān)規(guī)定，食品經(jīng)營許可證的辦理機(jī)構(gòu)是工商行政管理部門。具體到石景山超市、餐飲食堂、餐廳的食品經(jīng)營許可證辦理，應(yīng)向石景山工商行政管理部門提交相應(yīng)的申請材料，并經(jīng)過其審核和檢查，以確保符合食品安全法和相關(guān)法規(guī)的要求。

辦理食品經(jīng)營許可證需要提交以下相關(guān)材料和內(nèi)容：

需要提交的資料包括營業(yè)執(zhí)照副本。

還需要提供法定代表人的身份證復(fù)印件、健康管理人員的健康證和培訓(xùn)證原件和身份證復(fù)印件。

如果是租賃的經(jīng)營場所，還需要提交租賃合同復(fù)印件或是產(chǎn)權(quán)證。

需要提交辦公室方位圖和平面布局圖。

需要提交食品安全管理制度的清單原件一份。

這些材料和內(nèi)容應(yīng)詳細(xì)、真實(shí)、準(zhǔn)確，并按照《食品安全法》和總局的有關(guān)規(guī)定進(jìn)行審核和檢查，以確保申請者具備食品經(jīng)營的條件和能力，保證食品安全和衛(wèi)生。