三類醫(yī)療器械NMPA注冊的辦理流程如下：

準備申請材料，包括《醫(yī)療器械經(jīng)營企業(yè)許可申請表》、資格證明、營業(yè)執(zhí)照或企業(yè)名稱預先核準證明文件復印件、質(zhì)量管理人的資格證明、售后服務人員的資格證明等。

向所在地設區(qū)的市級人民政府食品藥品監(jiān)督管理部門提交申請，并提交上述材料。

工作人員受理資料，并于30個工作日內(nèi)進行審查，必要時組織核查。

對符合規(guī)定條件的，準予許可并發(fā)給醫(yī)療器械經(jīng)營許可證；對不符合規(guī)定條件的，不予許可并書面說明理由。

需要注意的是，辦理三類醫(yī)療器械NMPA注冊的具體流程可能因地區(qū)和政策的不同而有所差異，建議在辦理前先咨詢相關(guān)部門或機構(gòu)，了解具體的申請流程和要求。